3-индолацирк қышқылы - ауксин өсімдіктерінің бір түрі. Ауксиннің көптеген физиологиялық әсерлері бар, олар оның концентрациясымен байланысты. Төмен концентрация өсуге ықпал етуі мүмкін, ал жоғары концентрация өсімді тежейді, тіпті өсімдіктерді өлтіреді. Бұл тежегіш әсер этиленнің түзілуін тудыруы мүмкіндігімен байланысты. Ауксиннің физиологиялық әсері екі деңгейде көрінеді. Жасушалық деңгейде ауксин камбий жасушаларының бөлінуін ынталандыруы мүмкін; бұтақтардың созылуын ынталандырады және тамыр жасушаларының өсуін тежейді; ксилема мен флоэма жасушаларының дифференциациясына ықпал ету, тамыр кесінділерін дамыту және каллустың морфологиясын реттеу. Организмде және бүкіл өсімдік деңгейінде ауксин көшеттен жеміс піскенге дейін жұмыс істейді. Ауксин көшеттердегі гипокотил созылуының қайтымды қызыл жарық тежелуін бақылайды; ол өсінділердің астыңғы жағына ауысқанда, ол салалық геотропизмді тудырады; ол өсінділердің артқы жарық жағына ауысқанда, ол филиалдық фототропизм тудырады; 3-индолацет қышқылы апикальды артықшылық тудырады және жапырақтың қартаюын кешіктіреді. Ауксин гүлденуді жақсартады, партенокарпты жемісті дамытады және жемістердің жетілуін кешіктіреді.